构建高等教育自主知识体系是新时代哲学社会科学发展的重要命题。高等教育知识体系始终围绕“培养什么人、怎样培养人、为谁培养人”展开，其民族性与世界性的关系直接关涉育人方向与学术标准的实践性命题。文化哲学以文化为理解人的存在方式的根本视域，为审视高等教育知识体系中文化根基与全球共融的内在关联提供了理论依据。在近现代中国高等教育知识发展中，“西方性”曾被误作“世界性”乃至“普遍性”，这一历史偏向在一定程度上导致了我国高等教育知识体系的主体性缺位。对这一问题的反思，不仅有助于阐明高等教育知识体系中民族性与世界性相互转化、相互增益的关联逻辑，也进一步指向中国特色高等教育自主知识体系的构建路径。实践路径上，需从确立学术主体意识、推动传统文化现代转化、积极参与全球学术交流、健全学术评价与传播机制四个维度展开，构建兼具民族根基与世界视野的中国特色高等教育自主知识体系。